RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533768.5

PDE4DIP-232, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4DIP, Length 635 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-232ENST00000533768 MAP3K11Q16584 847 aa14.82□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 PODNQ7Z5L7 613 aa14.82□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.82□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 GGA1Q9UJY5 639 aa14.82□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 FZD1Q9UP38 647 aa14.82□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.82□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 ARHGEF6Q15052 776 aa14.81□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZNF428Q96B54 188 aa14.81□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 OGFOD1Q8N543 542 aa14.8□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.8□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 FAM89AQ96GI7 184 aa14.8□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.8□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 A0A1W2PPC1 479 aa14.79□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.79□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 PTPN18Q99952 460 aa14.79□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 UNCXA6NJT0 531 aa14.78□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 SASH1O94885 1247 aa14.78□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 MMP14P50281 582 aa14.78□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.77□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 OTOFQ9HC10 1997 aa14.77□□□□□ -0.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 DACT2Q5SW24 774 aa14.77□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 SHISA4Q96DD7 197 aa14.77□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 LRCH3Q96II8 777 aa14.77□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.77□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 MXD3Q9BW11 206 aa14.77□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.77□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 GJA5P36382 358 aa14.76□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.76□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.76□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.76□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 XDHP47989 1333 aa14.75□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.75□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.75□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 SPEF2Q9C093 1822 aa14.75□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 ATP2B4P23634 1241 aa14.74□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.74□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.74□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.74□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 NEFMP07197 916 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 MED23Q9ULK4 1368 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 MTFR1Q15390 333 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 GPR153Q6NV75 609 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 FBXW7Q969H0 707 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 ALPK3Q96L96 1907 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 NFE2L2Q16236 605 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 MYH3P11055 1940 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 GNRH1P01148 92 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 GJA8P48165 433 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 PRMT2P55345 433 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 KIF22Q14807 665 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 DEFB123Q8N688 67 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 OPTNQ96CV9 577 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 COA1Q9GZY4 146 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 VCANP13611 3396 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 GJB1P08034 283 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 PPP2R1AP30153 589 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 DLGAP5Q15398 846 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms