RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYL3P08590 195 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF853P0CG23 659 aa8.47□□□□□ -1.05
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 MPSTP25325 297 aa8.47□□□□□ -1.05
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 TSPAN7P41732 249 aa8.47□□□□□ -1.05
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 SETSIPP0DME0 302 aa8.46□□□□□ -1.06
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.46□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 IL16Q14005 1332 aa8.45□□□□□ -1.06
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALFQ53S48 1182 aa8.44□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPR153Q6NV75 609 aa8.44□□□□□ -1.06
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 DAAM2Q86T65 1068 aa8.44□□□□□ -1.06
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.44□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COMMD8Q9NX08 183 aa8.44□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIF16BQ96L93 1317 aa8.44□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NBPF14Q5TI25 921 aa8.43□□□□□ -1.06
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRIM52Q96A61 297 aa8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYLDQ9NQC7 956 aa8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.43□□□□□ -1.06
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