RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 CCT5P48643 541 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CCP110O43303 1012 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 FANCCQ00597 558 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 SGSM3Q96HU1 749 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 SLC24A3Q9HC58 644 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 PSME1Q06323 249 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 BRD3Q15059 726 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 PDILTQ8N807 584 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 GUCY1B3Q02153 619 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CASP8Q14790 479 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CFAP100Q494V2 611 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 USP28Q96RU2 1077 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CABP1Q9NZU7 370 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 IL13P35225 146 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 KCNJ6P48051 423 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CFAP45Q9UL16 551 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 L1RE1Q9UN81 338 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 VSNL1P62760 191 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 KIFC2Q96AC6 838 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 EHD4Q9H223 541 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 SERPINC1P01008 464 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 NPATQ14207 1427 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 ZSCAN12O43309 604 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 RNF40O75150 1001 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 ATP2B2Q01814 1243 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 A0A0U1RQJ8 604 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 FAM227BQ96M60 508 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 UBASH3AP57075 661 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 NECTIN1Q15223 517 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 LZTFL1Q9NQ48 299 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 MROH2AA6NES4 1674 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 GBP6Q6ZN66 633 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 GIMAP7Q8NHV1 300 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 FAM169AQ9Y6X4 670 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 ADKP55263 362 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 FAM71BQ8TC56 605 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 CD248Q9HCU0 757 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS1-205ENST00000527224 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 NCAPHQ15003 741 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 KIF1BO60333 1816 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 NDUFA8P51970 172 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 MYO1FO00160 1098 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 CHL1O00533 1208 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 IRF6O14896 467 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 SLC27A2O14975 620 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 BIRC2Q13490 618 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 MTF1Q14872 753 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 ADGRB1O14514 1584 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 CUTAO60888 179 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 ERLIN1O75477 346 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 SCRN1Q12765 414 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 MTX1Q13505 466 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 NEBLO76041 1014 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 PAX7P23759 505 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 TMEM139Q8IV31 216 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 SAMM50Q9Y512 469 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 AOX1Q06278 1338 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 MAP9Q49MG5 647 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-205ENST00000527224 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.36■■□□□ 1.01
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