RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	AOC2	O75106	756 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	SPRYD7	Q5W111	196 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	NLRP13	Q86W25	1043 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	NFAT5	O94916	1531 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	ROCK1	Q13464	1354 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	SCN4A	P35499	1836 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	ESPN	B1AK53	854 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23	7e-17	■■■■■ 61.9
PABPC1-223	ENST00000523636	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	CAPNS2	Q96L46	248 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	CDK15	Q96Q40	435 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	NFKBIE	O00221	500 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	IL2RB	P14784	551 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	LMNB1	P20700	586 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	PIM2	Q9P1W9	311 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	POGK	Q9P215	609 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	PIK3CD	O00329	1044 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	SIAH2	O43255	324 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	SKI	P12755	728 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	CHRNA5	P30532	468 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	LDHD	Q86WU2	507 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	RGS22	Q8NE09	1264 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L5	A8MUK1	530 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	SSFA2	P28290	1259 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-223	ENST00000523636	ITGB4	P16144	1822 aa		7.34	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	USP47	Q96K76	1375 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	RGL3	Q3MIN7	710 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	CDH23	Q9H251	3354 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PALLD	Q8WX93	1383 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ADH1C	P00326	375 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	RFX1	P22670	979 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	MAP2K2	P36507	400 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	GRM5	P41594	1212 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	GRM1	Q13255	1194 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	NR5A1	Q13285	461 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	EML3	Q32P44	896 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	CST9	Q5W186	159 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	LTN1	O94822	1766 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	CA12	O43570	354 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ATG7	O95352	703 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	NCOA4	Q13772	614 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	MTMR7	Q9Y216	660 aa		7.3	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms