RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 TSPOAP1O95153 1857 aa6.79□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 FOXO3O43524 673 aa6.79□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 PERM1Q5SV97 790 aa6.79□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.79□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO11Q86XK2 927 aa6.79□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 TTC9Q92623 222 aa6.79□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 IFT43Q96FT9 208 aa6.79□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.79□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 CD109Q6YHK3 1445 aa6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 PRMT3O60678 531 aa6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 MICAL2O94851 1124 aa6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 BRD1O95696 1058 aa6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 WEE1P30291 646 aa6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 GPLD1P80108 840 aa6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 MYO19Q96H55 970 aa6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 SASH3O75995 380 aa6.77□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 RARAP10276 462 aa6.77□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 PLAURQ03405 335 aa6.77□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.77□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.77□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.77□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.77□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 NRLP54845 237 aa6.76□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 LRP8Q14114 963 aa6.76□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 NBPF11Q86T75 865 aa6.76□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.76□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 HECW1Q76N89 1606 aa6.76□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 OPLAHO14841 1288 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 EGFRP00533 1210 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 ATP2B4P23634 1241 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 NOS3P29474 1203 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 CLIP1P30622 1438 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.73□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 KCNA1Q09470 495 aa6.73□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 SEPT3Q9UH03 358 aa6.73□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 ATP10BO94823 1461 aa6.73□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 ECM1Q16610 540 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 TREML1Q86YW5 311 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 USP20Q9Y2K6 914 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC2-216ENST00000523628 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 DLL1O00548 723 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 XYLBO75191 536 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 PSAPP07602 524 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINB4P48594 390 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 SIK1P57059 783 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 PDE4CQ08493 712 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 KIF14Q15058 1648 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 J3QW42 95 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 COX20Q5RI15 118 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 PLD4Q96BZ4 506 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 RNF112Q9ULX5 631 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 FANCAO15360 1455 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRL1O94910 1474 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 MMP20O60882 483 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 GHRHP01286 108 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 SOX18P35713 384 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 FAM26DQ5JW98 314 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.69□□□□□ -1.34
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