RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 MAPTP10636 758 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 NPR3P17342 541 aa10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 TREML1Q86YW5 311 aa10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa10.45□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ADGRB3O60242 1522 aa10.44□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 NOS1P29475 1434 aa10.44□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.44□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 IDH3AP50213 366 aa10.44□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ICMTO60725 284 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 FAM13AO94988 1023 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 FGFR3P22607 806 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 INPP5BP32019 993 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 HSPA1LP34931 641 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 KCNQ4P56696 695 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 GAS6Q14393 721 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 FAM26DQ5JW98 314 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 LCE2CQ5TA81 110 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 BRD7Q9NPI1 651 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 EID1Q9Y6B2 187 aa10.43□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 EPB42P16452 691 aa10.42□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ARSDP51689 593 aa10.42□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 MTMR3Q13615 1198 aa10.42□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 FAM182BQ5T319 152 aa10.42□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 MARK1Q9P0L2 795 aa10.42□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.42□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 NWD1Q149M9 1564 aa10.42□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 TET3O43151 1660 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 OPLAHO14841 1288 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 MPSTP25325 297 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 LTKP29376 864 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ANO2Q9NQ90 1003 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 MBIPQ9NS73 344 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 KCNH4Q9UQ05 1017 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.41□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 UNC13BO14795 1591 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ZBTB39O15060 712 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 MX2P20592 715 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 GMPRP36959 345 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ZAP70P43403 619 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 PIP4K2BP78356 416 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 STRN4Q9NRL3 753 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 HCN2Q9UL51 889 aa10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PDE4D-222ENST00000514552 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 H3BRB1 525 aa10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 CD33P20138 364 aa10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 CTBSQ01459 385 aa10.38□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 KRT76Q01546 638 aa10.38□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 ROCK1Q13464 1354 aa10.38□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 ZFYVE9O95405 1425 aa10.37□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.37□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 BMP4P12644 408 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 MAP2K3P46734 347 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 IDI1Q13907 227 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 ECM1Q16610 540 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 RGL4Q8IZJ4 473 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 DIP2AQ14689 1571 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 C2CD2LO14523 706 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 KCNA6P17658 529 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 EFCC1Q9HA90 598 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM94Q12767 1356 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 SPEM2Q0P670 501 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 ATCAYQ86WG3 371 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4D-222ENST00000514552 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa10.33□□□□□ -0.76
PDE4D-222ENST00000514552 WIPF1O43516 503 aa10.33□□□□□ -0.76
PDE4D-222ENST00000514552 EGFRP00533 1210 aa10.33□□□□□ -0.76
PDE4D-222ENST00000514552 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGAP4P98171 946 aa10.33□□□□□ -0.76
PDE4D-222ENST00000514552 AAMPQ13685 434 aa10.33□□□□□ -0.76
PDE4D-222ENST00000514552 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms