RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 MEIOBQ8N635 442 aa10.29□□□□□ -0.76
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MSC-AS1-202ENST00000512290 NEUROD1Q13562 356 aa10.21□□□□□ -0.77
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ITGB4P16144 1822 aa10.21□□□□□ -0.78
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIF13BQ9NQT8 1826 aa10.21□□□□□ -0.78
MSC-AS1-202ENST00000512290 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.2□□□□□ -0.78
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MSC-AS1-202ENST00000512290 CBLBQ13191 982 aa10.2□□□□□ -0.78
MSC-AS1-202ENST00000512290 GGNBP2Q9H3C7 697 aa10.2□□□□□ -0.78
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MSC-AS1-202ENST00000512290 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.19□□□□□ -0.78
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MSC-AS1-202ENST00000512290 VSIG8P0DPA2 414 aa10.19□□□□□ -0.78
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
MSC-AS1-202ENST00000512290 LDHDQ86WU2 507 aa10.19□□□□□ -0.78
MSC-AS1-202ENST00000512290 PNMA1Q8ND90 353 aa10.19□□□□□ -0.78
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MSC-AS1-202ENST00000512290 FIGNL2A6NMB9 653 aa10.18□□□□□ -0.78
MSC-AS1-202ENST00000512290 NPHP1O15259 732 aa10.18□□□□□ -0.78
MSC-AS1-202ENST00000512290 C21orf2O43822 256 aa10.18□□□□□ -0.78
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MSC-AS1-202ENST00000512290 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.17□□□□□ -0.78
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ADAM32Q8TC27 787 aa10.17□□□□□ -0.78
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