RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 MXD3Q9BW11 206 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNJ4P48050 445 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PLIN1O60240 522 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC24Q50LG9 513 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTROBQ8N137 903 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PCNTO95613 3336 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAF5O00463 557 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PODNQ7Z5L7 613 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DPF2Q92785 391 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXW7Q969H0 707 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 COA1Q9GZY4 146 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DACT2Q5SW24 774 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L3A6NCW0 530 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L4A6NCW7 530 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 GMLQ99445 158 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 H7C1D1 291 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 KLRG1Q96E93 195 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 DLK2Q6UY11 383 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CD209Q9NNX6 404 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CREBZFQ9NS37 354 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 JAG2Q9Y219 1238 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 RLBP1P12271 317 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 GYG1P46976 350 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2IP78347 998 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL24Q5JXM2 366 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CERS5Q8N5B7 392 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SIL1Q9H173 461 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTNAP1P78357 1384 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 USP17L8P0C7I0 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 IL1R1P14778 569 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE4AQ14139 1066 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 GGA3Q9NZ52 723 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ADM5C9JUS6 153 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 EYA2O00167 538 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 CST9Q5W186 159 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE8BO95263 885 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 GNAI3P08754 354 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 SASH1O94885 1247 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 USP48Q86UV5 1035 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 JMYQ8N9B5 988 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 FGFR2P21802 821 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 SCARF1Q14162 830 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms