RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 GNAI3P08754 354 aa31.27■■■□□ 2.6
CXCL3-202ENST00000502974 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM57Q8N5G2 664 aa31.27■■■□□ 2.6
CXCL3-202ENST00000502974 KLRG1Q96E93 195 aa31.27■■■□□ 2.6
CXCL3-202ENST00000502974 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CXCL3-202ENST00000502974 CREBZFQ9NS37 354 aa31.27■■■□□ 2.6
CXCL3-202ENST00000502974 SHTN1A0MZ66 631 aa31.26■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 PLIN1O60240 522 aa31.26■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 VIL1P09327 827 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 KLHDC4Q8TBB5 520 aa31.25■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 SNAP23O00161 211 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 KLRK1P26718 216 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 TXNRD3Q86VQ6 643 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 TRPM4Q8TD43 1214 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 COA1Q9GZY4 146 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 USP17L3A6NCW0 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 USP17L4A6NCW7 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 USP17L1Q7RTZ2 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC24Q50LG9 513 aa31.22■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 RCAN3Q9UKA8 241 aa31.22■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM88BA6NKF7 163 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 RLBP1P12271 317 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 AGBL3Q8NEM8 1001 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 FBXW7Q969H0 707 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 SAMD7Q7Z3H4 446 aa31.2■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF609O15014 1411 aa31.2■■■□□ 2.59
CXCL3-202ENST00000502974 MROH5Q6ZUA9 1318 aa31.2■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 ITPRIPQ8IWB1 547 aa31.19■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 METTL24Q5JXM2 366 aa31.18■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 PGAP2Q9UHJ9 254 aa31.17■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 TRPM7Q96QT4 1865 aa31.16■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 GNAI2P04899 355 aa31.16■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa31.16■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 IRS2Q9Y4H2 1338 aa31.16■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 TRAF5O00463 557 aa31.15■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 UBE4AQ14139 1066 aa31.15■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 STRIP1Q5VSL9 837 aa31.15■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 EYA2O00167 538 aa31.14■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 EGFRP00533 1210 aa31.14■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 USP17L8P0C7I0 530 aa31.14■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF804AQ7Z570 1209 aa31.14■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 PANK1Q8TE04 598 aa31.14■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 SIL1Q9H173 461 aa31.14■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 DACT2Q5SW24 774 aa31.13■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 GMLQ99445 158 aa31.13■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 CD209Q9NNX6 404 aa31.13■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 MYO3BQ8WXR4 1341 aa31.13■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 MS4A1P11836 297 aa31.12■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP31.12■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 TTLL5Q6EMB2 1281 aa31.12■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 CDC37L1Q7L3B6 337 aa31.12■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 JMYQ8N9B5 988 aa31.12■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 SRGAP3O43295 1099 aa31.11■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 VGLL2Q8N8G2 317 aa31.11■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 CNTNAP1P78357 1384 aa31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 PDE8BO95263 885 aa31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 GTF2IP78347 998 aa31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 MTX1Q13505 466 aa31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 MXD3Q9BW11 206 aa31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 ATG9AQ7Z3C6 839 aa31.09■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 OGFOD1Q8N543 542 aa31.09■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 MYOZ2Q9NPC6 264 aa31.09■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 FBXO3Q9UK99 471 aa31.09■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 CIAO1O76071 339 aa31.08■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 COPRSQ9NQ92 184 aa31.08■■■□□ 2.57
CXCL3-202ENST00000502974 GYG1P46976 350 aa31.07■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 C1orf115Q9H7X2 142 aa31.07■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 GGA3Q9NZ52 723 aa31.07■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 CELF2O95319 508 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 IL1R1P14778 569 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 KRT26Q7Z3Y9 468 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 USP48Q86UV5 1035 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF408Q9H9D4 720 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 CST9Q5W186 159 aa31.05■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa31.04■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 IL15P40933 162 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 SCARF1Q14162 830 aa31.04■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
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