RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499392.1

LRAT-202, Transcript of lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LRAT, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRAT-202ENST00000499392 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 J3QW42 95 aa7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 CPB1P15086 417 aa7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 TTC16Q8NEE8 873 aa7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.15□□□□□ -1.26
LRAT-202ENST00000499392 TSPOAP1O95153 1857 aa7.15□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 NID1P14543 1247 aa7.14□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 KCNMA1Q12791 1236 aa7.14□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 HYAL2Q12891 473 aa7.14□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PDE3BQ13370 1112 aa7.14□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 CEP120Q8N960 986 aa7.14□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.14□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 TRIM11Q96F44 468 aa7.14□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 GNB5O14775 395 aa7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 GPR182O15218 404 aa7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 LILRB5O75023 590 aa7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 CES1P23141 567 aa7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 TMC7Q7Z402 723 aa7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 NUDT8Q8WV74 236 aa7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PMEPA1Q969W9 287 aa7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.13□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 EREGO14944 169 aa7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PHACTR2O75167 634 aa7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PODNQ7Z5L7 613 aa7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PLD4Q96BZ4 506 aa7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.12□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 NFKBIEO00221 500 aa7.11□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 COL8A1P27658 744 aa7.11□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 DSC3Q14574 896 aa7.11□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.11□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 KDM6BO15054 1643 aa7.1□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 GHRHP01286 108 aa7.1□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 IRS1P35568 1242 aa7.1□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 BAG6P46379 1132 aa7.1□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ATP11AP98196 1134 aa7.1□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.1□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PLVAPQ9BX97 442 aa7.1□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PBX4Q9BYU1 374 aa7.1□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PIK3R2O00459 728 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 TREHO43280 583 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ACPPP15309 386 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 MAPK1P28482 360 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 RASSF7Q02833 373 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ORC1Q13415 861 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ASB16Q96NS5 453 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 ABCC2Q92887 1545 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.09□□□□□ -1.27
LRAT-202ENST00000499392 NEFLP07196 543 aa7.08□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.08□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.08□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 TMC1Q8TDI8 760 aa7.08□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 SPACA7Q96KW9 195 aa7.08□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 RBSNQ9H1K0 784 aa7.08□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.08□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.08□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 IQGAP2Q13576 1575 aa7.08□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 EDN3P14138 238 aa7.07□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 MSL1Q68DK7 614 aa7.07□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 DCAF5Q96JK2 942 aa7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 HHIPQ96QV1 700 aa7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 CSRNP1Q96S65 589 aa7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 ADAM19Q9H013 955 aa7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 DISP1Q96F81 1524 aa7.06□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LRAT-202ENST00000499392 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms