RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 ATP2B4P23634 1241 aa8.02□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 MMP14P50281 582 aa8.02□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.02□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.02□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.02□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.02□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.02□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 SASH1O94885 1247 aa8.01□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 SP3Q02447 781 aa8.01□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.01□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.01□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 LDLRAD1Q5T700 205 aa8□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 CHRDL2Q6WN34 429 aa8□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 ZNF333Q96JL9 665 aa8□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHF1Q96S99 279 aa8□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 MED23Q9ULK4 1368 aa7.99□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 PSME4Q14997 1843 aa7.99□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 H0YGN5 161 aa7.99□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.99□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.99□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 COA1Q9GZY4 146 aa7.99□□□□□ -1.13
CBX1-205ENST00000495350 HYPKQ9NX55 129 aa7.99□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 MXD3Q9BW11 206 aa7.98□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 OTUD5Q96G74 571 aa7.97□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.97□□□□□ -1.13
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CBX1-205ENST00000495350 MYD88Q99836 296 aa7.96□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.96□□□□□ -1.14
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CBX1-205ENST00000495350 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
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CBX1-205ENST00000495350 GTF2IP78347 998 aa7.95□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 NEUROD2Q15784 382 aa7.95□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.95□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 OPTNQ96CV9 577 aa7.95□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 ELP3Q9H9T3 547 aa7.95□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.95□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.95□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.95□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.95□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 CLRN2A0PK11 232 aa7.94□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 CHL1O00533 1208 aa7.94□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 GNRH1P01148 92 aa7.94□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 GJA5P36382 358 aa7.94□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 GTF2A2P52657 109 aa7.94□□□□□ -1.14
CBX1-205ENST00000495350 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
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