RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 CDC27P30260 824 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 SEC13P55735 322 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 DBX1A6NMT0 343 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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SENP6-208ENST00000483859 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.5□□□□□ -1.37
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SENP6-208ENST00000483859 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.5□□□□□ -1.37
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SENP6-208ENST00000483859 MUC3BQ9H195 1237 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.5□□□□□ -1.37
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SENP6-208ENST00000483859 HGSNATQ68CP4 663 aa6.49□□□□□ -1.37
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SENP6-208ENST00000483859 PRNPP04156 253 aa6.48□□□□□ -1.37
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SENP6-208ENST00000483859 ADMP35318 185 aa6.48□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 SOX18P35713 384 aa6.48□□□□□ -1.37
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SENP6-208ENST00000483859 FBXL18Q96ME1 805 aa6.48□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.48□□□□□ -1.37
SENP6-208ENST00000483859 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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SENP6-208ENST00000483859 GLMNQ92990 594 aa6.47□□□□□ -1.37
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SENP6-208ENST00000483859 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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SENP6-208ENST00000483859 NLRP13Q86W25 1043 aa6.45□□□□□ -1.38
SENP6-208ENST00000483859 FAM170BA6NMN3 283 aa6.44□□□□□ -1.38
SENP6-208ENST00000483859 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
SENP6-208ENST00000483859 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.44□□□□□ -1.38
SENP6-208ENST00000483859 OR13H1Q8NG92 308 aa6.44□□□□□ -1.38
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SENP6-208ENST00000483859 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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SENP6-208ENST00000483859 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
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SENP6-208ENST00000483859 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.41□□□□□ -1.38
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SENP6-208ENST00000483859 PBX4Q9BYU1 374 aa6.41□□□□□ -1.38
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SENP6-208ENST00000483859 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.39□□□□□ -1.39
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SENP6-208ENST00000483859 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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SENP6-208ENST00000483859 HHIPQ96QV1 700 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP6-208ENST00000483859 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP6-208ENST00000483859 H3BRJ5 948 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP6-208ENST00000483859 BNIP3Q12983 259 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP6-208ENST00000483859 PLCL1Q15111 1095 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP6-208ENST00000483859 CEP120Q8N960 986 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP6-208ENST00000483859 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SENP6-208ENST00000483859 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP6-208ENST00000483859 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP6-208ENST00000483859 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.38□□□□□ -1.39
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