RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 VEGFBP49765 207 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 GRIK5Q16478 980 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC57Q2TAC2 916 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 ATG9AQ7Z3C6 839 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 PODNQ7Z5L7 613 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP48Q86UV5 1035 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARHGAP45Q92619 1136 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 MEIS3Q99687 375 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 ANKRD2Q9GZV1 360 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 COA1Q9GZY4 146 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 CD209Q9NNX6 404 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 CREBZFQ9NS37 354 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 MED23Q9ULK4 1368 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP17L3A6NCW0 530 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP17L4A6NCW7 530 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 H7C1D1 291 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 RLBP1P12271 317 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 IL1R1P14778 569 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 FGFR2P21802 821 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 RPS12P25398 132 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 GTF2IP78347 998 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 SCARF1Q14162 830 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZIC5Q96T25 663 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 SCN9AQ15858 1988 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 RASSF10A6NK89 507 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ADM5C9JUS6 153 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 WNT10BO00744 389 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP17L8P0C7I0 530 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 GYG1P46976 350 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 BCAMP50895 628 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 UBE4AQ14139 1066 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMEM57Q8N5G2 664 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 CLUAP1Q96AJ1 413 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 JAG2Q9Y219 1238 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 SCN4AP35499 1836 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 CNTNAP1P78357 1384 aa5.01□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF609O15014 1411 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 G3V3G9 751 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 EYA2O00167 538 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 SASH1O94885 1247 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 PDE8BO95263 885 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 CELF2O95319 508 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 DEFB115Q30KQ5 88 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 TAF7LQ5H9L4 462 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 DCAF8Q5TAQ9 597 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 CYP4F22Q6NT55 531 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 MOB2Q70IA6 237 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 WBP1LQ9NX94 342 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 GGA3Q9NZ52 723 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZBED9Q6R2W3 1325 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM205AQ6ZU69 1335 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 CACNA1FO60840 1977 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 AOC2O75106 756 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 ADORA1P30542 326 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2Q1-204ENST00000476612 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms