RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 RASEFQ8IZ41 740 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 TAF5LO75529 589 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 SLC5A1P13866 664 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 KCNJ4P48050 445 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 BRD1O95696 1058 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 MCTP1Q6DN14 999 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 NLRP3Q96P20 1036 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 PKP1Q13835 747 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 SCARF1Q14162 830 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 RNF20Q5VTR2 975 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 ZAP70P43403 619 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 CCDC102BQ68D86 513 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 MCAMP43121 646 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 ZNF445P59923 1031 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-204ENST00000476231 CHRNDQ07001 517 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 TTC14Q96N46 770 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 SLC27A2O14975 620 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 CHGBP05060 677 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 COL4A1P02462 1669 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 PHKA1P46020 1223 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 TXNRD1Q16881 649 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 RXRBP28702 533 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 NFIXQ14938 502 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 A0A1B0GUL6 1792 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 PLSCR1O15162 318 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 MYH7P12883 1935 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 PSMA5P28066 241 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 PI16Q6UXB8 463 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 PROM2Q8N271 834 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 PANK2Q9BZ23 570 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 NPHP1O15259 732 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 MAST3O60307 1309 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 MBD3O95983 291 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 GYS1P13807 737 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 EP400Q96L91 3159 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 UBE4AQ14139 1066 aa22.7■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 TAF1P21675 1872 aa22.7■■□□□ 1.23
SYF2-204ENST00000476231 SNAP23O00161 211 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 KRT32Q14532 448 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 VPS53Q5VIR6 699 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 RUFY3Q7L099 469 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 CNBD1Q8NA66 436 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 APPBP2Q92624 585 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 SPATA5Q8NB90 893 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 OSBP2Q969R2 916 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 M0R2C6 588 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 APBA3O96018 575 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 TM4SF1P30408 202 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 AK2P54819 239 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 WASHC4Q2M389 1173 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 ADD2P35612 726 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms