RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP1-208	ENST00000475959	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP1-208	ENST00000475959	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNJ4	P48050	445 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNIP1	Q15025	636 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959		G3V3G9	751 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	GML	Q99445	158 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	COA1	Q9GZY4	146 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIL1	Q9H173	461 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	APLP1	P51693	650 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	EYA2	O00167	538 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAF5	O00463	557 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNAI3	P08754	354 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	GYG1	P46976	350 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	DPF2	Q92785	391 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTF2I	P78347	998 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTX1	Q13505	466 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE8B	O95263	885 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL1R1	P14778	569 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGFR2	P21802	821 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959		H7C1D1	291 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNAI2	P04899	355 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	AOX1	Q06278	1338 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	CIAO1	O76071	339 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	SASH1	O94885	1247 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRIK5	Q16478	980 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19

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