RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, human

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDZK1-204	ENST00000443667	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	EYA3	Q99504	573 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667		G3V3G9	751 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	NF2	P35240	595 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	UFL1	O94874	794 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	CRHR2	Q13324	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	LHX8	Q68G74	356 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	DPF3	Q92784	378 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	GML	Q99445	158 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SASH1	O94885	1247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PDIA6	Q15084	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	LRCH3	Q96II8	777 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	LAMB1	P07942	1786 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SP3	Q02447	781 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	WNK4	Q96J92	1243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	WNT10B	O00744	389 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PYGB	P11216	843 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PRO3102	Q9H379	93 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	INHBE	P58166	350 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	GJA5	P36382	358 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PTPN18	Q99952	460 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.58	□□□□□ -0.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
PDZK1-204	ENST00000443667	TIE1	P35590	1138 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PDZK1-204	ENST00000443667	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
PDZK1-204	ENST00000443667	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PDZK1-204	ENST00000443667	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PDZK1-204	ENST00000443667	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PDZK1-204	ENST00000443667	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PDZK1-204	ENST00000443667	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
PDZK1-204	ENST00000443667	GSE1	Q14687	1217 aa		11.56	□□□□□ -0.56

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