RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFAP54Q96N23 3096 aa11.93□□□□□ -0.5
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DOK7Q18PE1 504 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIMBP2O15034 1052 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INHAP05111 366 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NLRP3Q96P20 1036 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C5orf42Q9H799 3197 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
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