RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 RMND1Q9NWS8 449 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR78Q5VTH9 848 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 PI4KAP2A4QPH2 592 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 VAT1LQ9HCJ6 419 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TSHZ3Q63HK5 1081 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ATRIPQ8WXE1 791 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CTAGE1Q96RT6 745 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.43e-7■□□□□ 11
EFTUD2-202ENST00000426333 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 NECAB1Q8N987 351 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX12PQ92771 950 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 FERMT1Q9BQL6 677 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP2C2O75185 946 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.48e-6■■□□□ 12.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC174Q6PII3 467 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 KAT14Q9H8E8 782 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 DACT1Q9NYF0 836 aa12.55□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHDP01880 384 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 IVLP07476 585 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 GPTP24298 496 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA24Q86W54 205 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 RHPN1Q8TCX5 695 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBB4AP04350 444 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ANO6Q4KMQ2 910 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC1Q9NV70 894 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 STX8Q9UNK0 236 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 BAG3O95817 575 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 FERMT2Q96AC1 680 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ALKQ9UM73 1620 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 SLU7O95391 586 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 SDSP20132 328 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 RRAGBQ5VZM2 374 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 FEZ1Q99689 392 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa12.54□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PRG0 241 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMA7O14818 248 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB43O43298 467 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TCEANC2Q96MN5 208 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TULP4Q9NRJ4 1543 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC6Q16204 474 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC77Q9BR77 488 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 RSPH14Q9UHP6 348 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 FERP16591 822 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMYND15Q9H091 742 aa12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf229H3BNL8 230 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TACC1O75410 805 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 AFMP43652 599 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 WTAPQ15007 396 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TMTC2Q8N394 836 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TSNARE1Q96NA8 513 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ALG1Q9BT22 464 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMM50Q9Y512 469 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 SELENOOQ9BVL4 669 aa12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 CNPY2Q9Y2B0 182 aa12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMYM3Q14202 1370 aa12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXO3O43524 673 aa12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 OPA1O60313 960 aa12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3R4Q99570 1358 aa12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 USP48Q86UV5 1035 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ERMNQ8TAM6 284 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPN2P17655 700 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PTGS1P23219 599 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE1AP54750 535 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 NUCB1Q02818 461 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF5AQ12840 1032 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 AOPEPQ8N6M6 819 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 IL16Q14005 1332 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF4AO95239 1232 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms