RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CHRNA2Q15822 529 aa25.38■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.38■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 USP28Q96RU2 1077 aa25.38■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.38■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 MAST3O60307 1309 aa25.38■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 FOSBP53539 338 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CTAGE5O15320 804 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CDC25BP30305 580 aa25.37■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.36■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 SARM1Q6SZW1 724 aa25.36■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 LRRC24Q50LG9 513 aa25.36■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 ATL3Q6DD88 541 aa25.36■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 EYA2O00167 538 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 STX1AQ16623 288 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 A0A1B0GUL7 405 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TMEM200B-201ENST00000420504 FBXL16Q8N461 479 aa25.33■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.33■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 M0R2C6 588 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 PPFIA3O75145 1194 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 CHST3Q7LGC8 479 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 CIAO1O76071 339 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 EVCP57679 992 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 PRDM4Q9UKN5 801 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 GUCY1B3Q02153 619 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD7Q92527 254 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 ATG3Q9NT62 314 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 OSBP2Q969R2 916 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 KINO60870 393 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 FOXP2O15409 715 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 A1BGP04217 495 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 ATF3P18847 181 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 FSIP1Q8NA03 581 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 ME1P48163 572 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 CPDO75976 1380 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 PAPPAQ13219 1627 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 A0A087WWV3 80 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 ATP2B3Q16720 1220 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 ANO10Q9NW15 660 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM200B-201ENST00000420504 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 SMTNL1A8MU46 457 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 TNNT1P13805 278 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 CBX1P83916 185 aa25.26■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 DCCP43146 1447 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 ARID5BQ14865 1188 aa25.25■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 ADALQ6DHV7 355 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 BECN2A8MW95 431 aa25.24■■□□□ 1.63
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