RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 BTG4Q9NY30 223 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPRTO14522 1441 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PICALMQ13492 652 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 SAMM50Q9Y512 469 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 SPTLC2O15270 562 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 UBASH3AP57075 661 aa24.51■■□□□ 1.51
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PTPRJ-201ENST00000418331 CALM1P0DP23 149 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 CALM2P0DP24 149 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 CALM3P0DP25 149 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM89AQ96GI7 184 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.5■■□□□ 1.51
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PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM75PA6NK02 468 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 EYA2O00167 538 aa24.5■■□□□ 1.51
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PTPRJ-201ENST00000418331 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ERMNQ8TAM6 284 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 NAPAP54920 295 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TIMM10P62072 90 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 RTL9Q8NET4 1388 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAF1Q13077 416 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.48■■□□□ 1.51
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PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GUL7 405 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 USP19O94966 1318 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 USP8P40818 1118 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 OGFOD1Q8N543 542 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 NEBLO76041 1014 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PLCG2P16885 1265 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 CALML3P27482 149 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TNNI3KQ59H18 835 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRJ-201ENST00000418331 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.46■■□□□ 1.51
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PTPRJ-201ENST00000418331 RTL1A6NKG5 1358 aa24.46■■□□□ 1.51
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PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.45■■□□□ 1.51
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PTPRJ-201ENST00000418331 GNG11P61952 73 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.45■■□□□ 1.5
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PTPRJ-201ENST00000418331 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf50Q9HD87 102 aa24.44■■□□□ 1.5
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PTPRJ-201ENST00000418331 CEP170Q5SW79 1584 aa24.44■■□□□ 1.5
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PTPRJ-201ENST00000418331 ITGA6P23229 1130 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 DHX58Q96C10 678 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 AKR1B10O60218 316 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 MBD4O95243 580 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP135Q66GS9 1140 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 BRAPQ7Z569 592 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 TYRO3Q06418 890 aa24.43■■□□□ 1.5
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PTPRJ-201ENST00000418331 RXRAP19793 462 aa24.43■■□□□ 1.5
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PTPRJ-201ENST00000418331 SKILP12757 684 aa24.42■■□□□ 1.5
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PTPRJ-201ENST00000418331 PARP10Q53GL7 1025 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 AOX1Q06278 1338 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 ASIC1P78348 528 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT2P35908 639 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
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