RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SLIT2O94813 1529 aa4.8□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0D9SFI3 127 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GUL7 405 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 ERVV-1B6SEH8 477 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF5P55010 431 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 VPS72Q15906 364 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 ITGA6P23229 1130 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 TUSC1Q2TAM9 212 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM182BQ5T319 152 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 GORABQ5T7V8 394 aa4.79□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 GREM2Q9H772 168 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 PLCH1Q4KWH8 1693 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 PALLDQ8WX93 1383 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLIM4O00461 696 aa4.79□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 MCM2P49736 904 aa4.79□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 HAUS7Q99871 368 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR108Q9NPR9 543 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC171Q6TFL3 1326 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 UBN2Q6ZU65 1347 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa4.78□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 CTSWP56202 376 aa4.78□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 PTF1AQ7RTS3 328 aa4.78□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.78□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 BCL9LQ86UU0 1499 aa4.78□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 CDHR2Q9BYE9 1310 aa4.78□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP188Q5SRE5 1749 aa4.78□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE8AO60658 829 aa4.78□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 MAP4K1Q92918 833 aa4.78□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 GBP4Q96PP9 640 aa4.78□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC158Q5M9N0 1113 aa4.78□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 AK9Q5TCS8 1911 aa4.78□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 DOT1LQ8TEK3 1739 aa4.77□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 IL17RAQ96F46 866 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3TC1Q8TE82 1336 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TJP1Q07157 1748 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX11L8A8MPP1 907 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC27A2O14975 620 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR37O15354 613 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAK2O60296 914 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF5LO75529 589 aa4.77□□□□□ -1.65
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