RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 ARID5AQ03989 594 aa11.1□□□□□ -0.63
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HERC3-202ENST00000402738 SPAG5Q96R06 1193 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 EFCC1Q9HA90 598 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 STIM2Q9P246 746 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 A6NNZ2 444 aa11.09□□□□□ -0.63
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HERC3-202ENST00000402738 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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HERC3-202ENST00000402738 SETDB1Q15047 1291 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 ATP2B3Q16720 1220 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 TUBB8Q3ZCM7 444 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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HERC3-202ENST00000402738 CHST3Q7LGC8 479 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 TSPYL6Q8N831 410 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 IFT74Q96LB3 600 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 POTEJP0CG39 1038 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 C8orf74Q6P047 294 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 PSMA7O14818 248 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 TNNC1P63316 161 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 MAP3K9P80192 1104 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 PPFIA1Q13136 1202 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 TMEM266Q2M3C6 531 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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HERC3-202ENST00000402738 CALML4Q96GE6 196 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 RAB34Q9BZG1 259 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ELP1O95163 1332 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 E7EVH7 732 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ZNF76P36508 570 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MTX1Q13505 466 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SEPT6Q14141 434 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 LRRC8AQ8IWT6 810 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TERF2Q15554 542 aa11.08□□□□□ -0.64
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HERC3-202ENST00000402738 CATIPQ7Z7H3 387 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 IQCA1Q86XH1 822 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 HECW1Q76N89 1606 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB43O43298 467 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CTNNA2P26232 953 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MIPOL1Q8TD10 442 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PPP2R5AQ15172 486 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SMC6Q96SB8 1091 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 VAMP4O75379 141 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CCDC25Q86WR0 208 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CCDC77Q9BR77 488 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 33.8
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HERC3-202ENST00000402738 CCT5P48643 541 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ANXA1P04083 346 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 FBLN1P23142 703 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ACTN2P35609 894 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TRIM7Q9C029 511 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 A0A087WZG4 1122 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PRC1O43663 620 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 STMN2Q93045 179 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TOP2BQ02880 1626 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 VPS16Q9H269 839 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
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