RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PPARG-208	ENST00000397023	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PPARG-208	ENST00000397023	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PPARG-208	ENST00000397023	LAMA4	Q16363	1823 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PPARG-208	ENST00000397023	ZSCAN12	O43309	604 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	COL15A1	P39059	1388 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SMC2	O95347	1197 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	NLRP12	P59046	1061 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	TMC6	Q7Z403	805 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	PALLD	Q8WX93	1383 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	TUBB4B	P68371	445 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	IP6K1	Q92551	441 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF609	O15014	1411 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	TADA3	O75528	432 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	CYP21A2	P08686	494 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	STK38	Q15208	465 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	AK7	Q96M32	723 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	HAUS7	Q99871	368 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SLIT3	O75094	1523 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	NFAT5	O94916	1531 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	KCNA6	P17658	529 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	DTNB	O60941	627 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	PLA2G4A	P47712	749 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	EVC	P57679	992 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	CMA1	P23946	247 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	FANCC	Q00597	558 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ABTB2	Q8N961	1025 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PPARG-208	ENST00000397023	SPTLC2	O15270	562 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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