RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.58■□□□□ 0.89
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.58■□□□□ 0.89
NME1-NME2-202ENST00000393193 DACT2Q5SW24 774 aa20.57■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 JMYQ8N9B5 988 aa20.57■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.57■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 COA1Q9GZY4 146 aa20.57■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 CREBZFQ9NS37 354 aa20.57■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM27P14373 513 aa20.56■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.56■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.56■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.56■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.55■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.55■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP17L3A6NCW0 530 aa20.54■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP17L4A6NCW7 530 aa20.54■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.54■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.53■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 H7C1D1 291 aa20.53■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.53■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.53■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 MEIS3Q99687 375 aa20.53■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 CD209Q9NNX6 404 aa20.53■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.53■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRAF5O00463 557 aa20.52■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL1R1P14778 569 aa20.52■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRC24Q50LG9 513 aa20.52■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.52■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 MXD3Q9BW11 206 aa20.52■□□□□ 0.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 CNTNAP1P78357 1384 aa20.51■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBE4AQ14139 1066 aa20.51■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 CST9Q5W186 159 aa20.51■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.51■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.5■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 G3V3G9 751 aa20.5■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.5■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.5■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.5■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNJ4P48050 445 aa20.49■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.49■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.49■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 CERS5Q8N5B7 392 aa20.49■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.49■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 RASSF10A6NK89 507 aa20.48■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP17L8P0C7I0 530 aa20.48■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 MTX1Q13505 466 aa20.48■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.48■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 FGFR2P21802 821 aa20.47■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 DLK2Q6UY11 383 aa20.47■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 EYA2O00167 538 aa20.46■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLIN1O60240 522 aa20.46■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDE8BO95263 885 aa20.46■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 GTF2IP78347 998 aa20.46■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.46■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.46■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.46■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.46■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.46■□□□□ 0.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.45■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.45■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBXO3Q9UK99 471 aa20.45■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 RLBP1P12271 317 aa20.44■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 GYG1P46976 350 aa20.44■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.44■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 COPRSQ9NQ92 184 aa20.44■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 CIAO1O76071 339 aa20.43■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 SASH1O94885 1247 aa20.43■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 GNAI3P08754 354 aa20.43■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 MMP14P50281 582 aa20.43■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCARF1Q14162 830 aa20.43■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 METTL24Q5JXM2 366 aa20.43■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.43■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 GGA3Q9NZ52 723 aa20.43■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.43■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADM5C9JUS6 153 aa20.42■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP48Q86UV5 1035 aa20.42■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.42■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 WNT10BO00744 389 aa20.41■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 VEGFBP49765 207 aa20.41■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.41■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 194.1 ms