RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 BAG6P46379 1132 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 MAP3K12Q12852 859 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 UBE3CQ15386 1083 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 VPS37DQ86XT2 251 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 PROM2Q8N271 834 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 APPBP2Q92624 585 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-204ENST00000380776 A0A0D9SFI3 127 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 TAF5LO75529 589 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 MCAMP43121 646 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZAP70P43403 619 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 NEK4P51957 841 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 NECTIN1Q15223 517 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD1Q15327 319 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CRY2Q49AN0 593 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 POTEAQ6S8J7 498 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SPATA5Q8NB90 893 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM227BQ96M60 508 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 STK32BQ9NY57 414 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 PDE6BP35913 854 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 PHKA1P46020 1223 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC4A3P48751 1232 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 WASHC4Q2M389 1173 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC125Q86Z20 511 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 XDHP47989 1333 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC27A2O14975 620 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 GNAT2P19087 354 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ATP2B4P23634 1241 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ALDH1B1P30837 517 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ADD2P35612 726 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 NUCB2P80303 420 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 PTH1RQ03431 593 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 VPS53Q5VIR6 699 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 IL25Q9H293 177 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 MYH7P12883 1935 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 NPR1P16066 1061 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 PTMSP20962 102 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 RASGRF1Q13972 1273 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC15A2Q16348 729 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF827Q17R98 1081 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SMIM5Q71RC9 77 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 RUFY3Q7L099 469 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CERS3Q8IU89 383 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 AIDAQ96BJ3 306 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms