RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375478.3

NXPE4-201, Transcript of neurexophilin and PC-esterase domain family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NXPE4, Length 1,822 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4-201ENST00000375478 SP8Q8IXZ3 490 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 SNRKQ9NRH2 765 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 XDHP47989 1333 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 SDSP20132 328 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 KCNJ4P48050 445 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 CCDC102BQ68D86 513 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 CNKSR1Q969H4 720 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 SNED1Q8TER0 1413 aa16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 UTRNP46939 3433 aa16.09■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.09■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.09■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 UBE4AQ14139 1066 aa16.08■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 GORABQ5T7V8 394 aa16.08■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 TTLL6Q8N841 843 aa16.08■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.08■□□□□ 0.17
NXPE4-201ENST00000375478 AOX1Q06278 1338 aa16.08■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 CHGBP05060 677 aa16.08■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 MCAMP43121 646 aa16.08■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 TGFB2P61812 414 aa16.08■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.08■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.08■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 ATP5JP18859 108 aa16.07■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 GPATCH3Q96I76 525 aa16.07■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 ANTXR1Q9H6X2 564 aa16.07■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.07■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 GGA1Q9UJY5 639 aa16.07■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 JAG2Q9Y219 1238 aa16.07■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 C6orf229H3BNL8 230 aa16.06■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 RASGRF1Q13972 1273 aa16.06■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 MPNDQ8N594 471 aa16.06■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 RIMBP2O15034 1052 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 C8orf34Q49A92 452 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 TMC4Q7Z404 712 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 RILPL2Q969X0 211 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 PIM2Q9P1W9 311 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 ZAP70P43403 619 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 SLFNL1Q499Z3 407 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 HAUS7Q99871 368 aa16.05■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 GOLIM4O00461 696 aa16.04■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 ERC2O15083 957 aa16.04■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 ATP2B4P23634 1241 aa16.04■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.04■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.04■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 BCS1LQ9Y276 419 aa16.04■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.03■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 COL4A5P29400 1685 aa16.03■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 MED23Q9ULK4 1368 aa16.02■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 SEC24BO95487 1268 aa16.02■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 DOK7Q18PE1 504 aa16.02■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 IL25Q9H293 177 aa16.02■□□□□ 0.16
NXPE4-201ENST00000375478 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 CCDC93Q567U6 631 aa16.01■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 SYT17Q9BSW7 474 aa16.01■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.01■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 AOC3Q16853 763 aa16.01■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.01■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 VPS37DQ86XT2 251 aa16.01■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 SPATA5Q8NB90 893 aa16.01■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 AK9Q5TCS8 1911 aa16■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 WASHC4Q2M389 1173 aa16■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 KCNQ5Q9NR82 932 aa16■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 CHD4Q14839 1912 aa16■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 NFKBIEO00221 500 aa15.99■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.99■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 RASSF7Q02833 373 aa15.99■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 FSD1Q9BTV5 496 aa15.99■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.99■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 CD209Q9NNX6 404 aa15.99■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 CDC45O75419 566 aa15.98■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 PRELPP51888 382 aa15.98■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 GRIK5Q16478 980 aa15.98■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 CNTROBQ8N137 903 aa15.98■□□□□ 0.15
NXPE4-201ENST00000375478 EVI5LQ96CN4 794 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms