RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 OSMRQ99650 979 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 PBX4Q9BYU1 374 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 NPHS2Q9NP85 383 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PP55 124 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGB2P05107 769 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP2B2Q01814 1243 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP135Q66GS9 1140 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 PI16Q6UXB8 463 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 FBF1Q8TES7 1133 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 LILRB5O75023 590 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 PROCP04070 461 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 DGKGP49619 791 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 GRIK5Q16478 980 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.339e-54■■■■■ 28.8
RABGGTB-202ENST00000370826 HHIPQ96QV1 700 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 RRAGCQ9HB90 399 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.338e-15■■■■□ 24
RABGGTB-202ENST00000370826 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 NXPE3Q969Y0 559 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 TCF12Q99081 682 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 EHD4Q9H223 541 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF19AQ9NV58 838 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 NID1P14543 1247 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 FGD1P98174 961 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 GRM2Q14416 872 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 ILDR2Q71H61 639 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 CCNJLQ8IV13 435 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 GIPC2Q8TF65 315 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 BAG6P46379 1132 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 BCO2Q9BYV7 579 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM19Q9H013 955 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 PARP2Q9UGN5 583 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 METTL12A8MUP2 240 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPRAP18433 802 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 GNA15P30679 374 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 GRIA4P48058 902 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 MSL1Q68DK7 614 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM11Q96F44 468 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 FRMD6Q96NE9 622 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SPG7Q9UQ90 795 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 GNB5O14775 395 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 GIPC1O14908 333 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC27P30260 824 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 DAB2P98082 770 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 BSNDQ8WZ55 320 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCB6Q9NP58 842 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A096LPE4 126 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPZ6 126 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 TMC4Q7Z404 712 aa6.69□□□□□ -1.34
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