RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ABI1Q8IZP0 508 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 KIF4AO95239 1232 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 SLC24A1O60721 1099 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 JAG1P78504 1218 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 SPACA7Q96KW9 195 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 WDR64B1ANS9 1081 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 PBX4Q9BYU1 374 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 A6NJR5 290 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 TNFRSF10BO14763 440 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 OGFOD2Q6N063 350 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 CEP120Q8N960 986 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM19Q9H013 955 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 SCNN1AP37088 669 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 C16orf46Q6P387 395 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 PIM2Q9P1W9 311 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 OCLNQ16625 522 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 MSMPQ1L6U9 139 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZMYND15Q9H091 742 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 PTPRAP18433 802 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 CBLL1Q75N03 491 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 RNF208Q9H0X6 261 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 H3BRJ5 948 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 PRMT3O60678 531 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZAP70P43403 619 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 NLRP12P59046 1061 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 PIP4K2BP78356 416 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 SGO2Q562F6 1265 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 WNT8BQ93098 351 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 F13BP05160 661 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 SHISA5Q8N114 240 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 COL19A1Q14993 1142 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 CDCA8Q53HL2 280 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 FDX2Q6P4F2 183 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 GPR152Q8TDT2 470 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 PRNPP04156 253 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 C8AP07357 584 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ACPPP15309 386 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 FOSL1P15407 271 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 HGSNATQ68CP4 663 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 MEGF11A6BM72 1044 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 NFKBIEO00221 500 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB39O15060 712 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 FBXL6Q8N531 539 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ATG3Q9NT62 314 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 FAM177BA6PVY3 158 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ITGB5P18084 799 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 CABP4P57796 275 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 CNTN3Q9P232 1028 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 RFX1P22670 979 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 HHIPQ96QV1 700 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ELP3Q9H9T3 547 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 SOX13Q9UN79 622 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 TIAF1O95411 115 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms