RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367094.6

TULP4-201, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TULP4, Length 5,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-201ENST00000367094 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.65□□□□□ -0.54
TULP4-201ENST00000367094 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CETN1Q12798 172 aa11.65□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 NECAB1Q8N987 351 aa11.65□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.65□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 PRC1O43663 620 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CYP7A1P22680 504 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CALML3P27482 149 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 SSH2Q76I76 1423 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 TUBB4BP68371 445 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 NGLY1Q96IV0 654 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ADAMTS2O95450 1211 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 SLC39A6Q13433 755 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ATP7BP35670 1465 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 NBPF4Q96M43 638 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.64□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 PLCG2P16885 1265 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 FAM193AP78312 1265 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ERMNQ8TAM6 284 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 NLRP3Q96P20 1036 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CABP5Q9NP86 173 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 RFC4P35249 363 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ABCC4O15439 1325 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 KCNA6P17658 529 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CEP135Q66GS9 1140 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.63□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 SPTLC2O15270 562 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 FERP16591 822 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 SETDB2Q96T68 719 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 EXOC1Q9NV70 894 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 DACT1Q9NYF0 836 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 MLH3Q9UHC1 1453 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 C6orf229H3BNL8 230 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CCDC172P0C7W6 258 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 TFCP2Q12800 502 aa11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ATP6V1AP38606 617 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 UBASH3AP57075 661 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 BIN1O00499 593 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 KIF1BO60333 1816 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 TRIM75PA6NK02 468 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 TSPY3P0CV98 308 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 TSPY8P0CW00 308 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 PARP10Q53GL7 1025 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ZNF790Q6PG37 636 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 LRRC45Q96CN5 670 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ERVK-7P63135 1459 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 FSD2A1L4K1 749 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 RPS6KB1P23443 525 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 TYRO3Q06418 890 aa11.61□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 DDB1Q16531 1140 aa11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 EYA2O00167 538 aa11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.553e-6■■■□□ 18.4
TULP4-201ENST00000367094 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 PLVAPQ9BX97 442 aa11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 PTPDC1A2A3K4 754 aa11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TULP4-201ENST00000367094 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms