RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-201ENST00000361543 UTYO14607 1347 aa9.67□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 TRAF5O00463 557 aa9.67□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
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SGMS1-201ENST00000361543 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 KCNJ4P48050 445 aa9.67□□□□□ -0.86
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SGMS1-201ENST00000361543 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
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SGMS1-201ENST00000361543 TAF7LQ5H9L4 462 aa9.67□□□□□ -0.86
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SGMS1-201ENST00000361543 USP17L4A6NCW7 530 aa9.66□□□□□ -0.86
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SGMS1-201ENST00000361543 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.66□□□□□ -0.86
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SGMS1-201ENST00000361543 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
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SGMS1-201ENST00000361543 SCARF1Q14162 830 aa9.61□□□□□ -0.87
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SGMS1-201ENST00000361543 SULF1Q8IWU6 871 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-201ENST00000361543 OGFOD1Q8N543 542 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-201ENST00000361543 CAPNS2Q96L46 248 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-201ENST00000361543 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-201ENST00000361543 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-201ENST00000361543 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-201ENST00000361543 IL1R1P14778 569 aa9.6□□□□□ -0.87
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