RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.34□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.34□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 RAD21O60216 631 aa7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 PDE8BO95263 885 aa7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ATP2B3Q16720 1220 aa7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CCDC125Q86Z20 511 aa7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 XAGE2Q96GT9 111 aa7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CHMLP26374 656 aa7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ADORA1P30542 326 aa7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 EVI5LQ96CN4 794 aa7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 FGFR2P21802 821 aa7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CHRNDQ07001 517 aa7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 MSL1Q68DK7 614 aa7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 HAUS7Q99871 368 aa7.32□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 TAF5LO75529 589 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 GORABQ5T7V8 394 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 LPIN2Q92539 896 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 MMP10P09238 476 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 SLC5A1P13866 664 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 MCCP23508 829 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 GRAPQ13588 217 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CRY2Q49AN0 593 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.31□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 FSD1Q9BTV5 496 aa7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa7.3□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 HIP1O00291 1037 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 SNAP23O00161 211 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 REC8O95072 547 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CCDC102BQ68D86 513 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 USP26Q9BXU7 913 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 MYH7P12883 1935 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 GOLIM4O00461 696 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 PHKA1P46020 1223 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 UBE4AQ14139 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 MPNDQ8N594 471 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 CACNA1SQ13698 1873 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 PDE6BP35913 854 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 MCAMP43121 646 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 SCARF1Q14162 830 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 IL25Q9H293 177 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 DOCK2Q92608 1830 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 SGSM2O43147 1006 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 RGS22Q8NE09 1264 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 ZAP70P43403 619 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 SNRKQ9NRH2 765 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 LTBP1Q14766 1721 aa7.27□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.27□□□□□ -1.24
CCR6-201ENST00000341935 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms