RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.2■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 TAF1P21675 1872 aa24.2■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 ANAPC15P60006 121 aa24.19■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 MED23Q9ULK4 1368 aa24.19■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 MCM4P33991 863 aa24.19■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 PHKA1P46020 1223 aa24.19■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 SCARF1Q14162 830 aa24.19■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 UBE4AQ14139 1066 aa24.18■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 IL27Q8NEV9 243 aa24.18■■□□□ 1.46
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SUMO3-201ENST00000332859 GRAPQ13588 217 aa24.17■■□□□ 1.46
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SUMO3-201ENST00000332859 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.16■■□□□ 1.46
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SUMO3-201ENST00000332859 SLC15A2Q16348 729 aa24.16■■□□□ 1.46
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SUMO3-201ENST00000332859 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.14■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.14■■□□□ 1.46
SUMO3-201ENST00000332859 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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SUMO3-201ENST00000332859 PI16Q6UXB8 463 aa24.14■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
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SUMO3-201ENST00000332859 PALD1Q9ULE6 856 aa24.13■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 KCNJ4P48050 445 aa24.12■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.12■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.12■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 MCM2P49736 904 aa24.12■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 SPATA5Q8NB90 893 aa24.12■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.12■■□□□ 1.45
SUMO3-201ENST00000332859 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
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SUMO3-201ENST00000332859 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.11■■□□□ 1.45
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SUMO3-201ENST00000332859 KCNB2Q92953 911 aa24.07■■□□□ 1.44
SUMO3-201ENST00000332859 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.07■■□□□ 1.44
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.07■■□□□ 1.44
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SUMO3-201ENST00000332859 VPS37DQ86XT2 251 aa24.07■■□□□ 1.44
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SUMO3-201ENST00000332859 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.06■■□□□ 1.44
SUMO3-201ENST00000332859 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.06■■□□□ 1.44
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SUMO3-201ENST00000332859 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.05■■□□□ 1.44
SUMO3-201ENST00000332859 TMC4Q7Z404 712 aa24.05■■□□□ 1.44
SUMO3-201ENST00000332859 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SUMO3-201ENST00000332859 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.05■■□□□ 1.44
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