RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 MAST3O60307 1309 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 M0R2C6 588 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 PHF14O94880 888 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 NUCB2P80303 420 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 C4AP0C0L4 1744 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 SLC5A1P13866 664 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 PSMA5P28066 241 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 OSBP2Q969R2 916 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 GBP4Q96PP9 640 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 CHRNDQ07001 517 aa21.39■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.39■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.39■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 NYXQ9GZU5 481 aa21.39■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.39■■□□□ 1.02
ACTB-201ENST00000331789 LARGE1O95461 756 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 CYP21A2P08686 494 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 WASHC4Q2M389 1173 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 RFC4P35249 363 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 TRIM37O94972 964 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 RPS6KB1P23443 525 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GUL6 1792 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 GSE1Q14687 1217 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 A0A0G2JLW4 131 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 KRT32Q14532 448 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 APPBP2Q92624 585 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 LAMA4Q16363 1823 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 BCAMP50895 628 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 NLRP3Q96P20 1036 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.018e-19■□□□□ 10.2
ACTB-201ENST00000331789 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 SPATA5Q8NB90 893 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 NEK1Q96PY6 1258 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 TRAK2O60296 914 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 ADD2P35612 726 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 RASGRF1Q13972 1273 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 ME3Q16798 604 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-201ENST00000331789 FOXP2O15409 715 aa21.33■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.33■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 ST3GAL1Q11201 340 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 NFIXQ14938 502 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 DTNBO60941 627 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 BRD1O95696 1058 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 NECAB1Q8N987 351 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 GPAA1O43292 621 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 PDE6AP16499 860 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD1Q15327 319 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 DOCK2Q92608 1830 aa21.3■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
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