RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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HOXC5-201ENST00000312492 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HOXC5-201ENST00000312492 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXC5-201ENST00000312492 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.4■□□□□ 0.86
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HOXC5-201ENST00000312492 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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HOXC5-201ENST00000312492 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
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HOXC5-201ENST00000312492 GYG1P46976 350 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC5-201ENST00000312492 DDR1Q08345 913 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC5-201ENST00000312492 VPS37DQ86XT2 251 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC5-201ENST00000312492 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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HOXC5-201ENST00000312492 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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