RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 KIAA0754O94854 1291 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 TRIM75PA6NK02 468 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 SGSM2O43147 1006 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 PAFAH1B1P43034 410 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 CEP135Q66GS9 1140 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 PAF1Q8N7H5 531 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 ST5P78524 1137 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 FAM227BQ96M60 508 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 SUCLG2Q96I99 432 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 ATP10AO60312 1499 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 RTL1A6NKG5 1358 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 LUZP1Q86V48 1076 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 DTNBO60941 627 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 GNAQP50148 359 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 A1BGP04217 495 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 C8orf37Q96NL8 207 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 GNAT2P19087 354 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 DHX58Q96C10 678 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-201ENST00000308580 STAT6P42226 847 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 BTG4Q9NY30 223 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 SLC27A2O14975 620 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 EXOC1Q9NV70 894 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 RMND1Q9NWS8 449 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 JAG2Q9Y219 1238 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 MBD4O95243 580 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 PICALMQ13492 652 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 RPS6KB1P23443 525 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 POTEJP0CG39 1038 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 MAP9Q49MG5 647 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 SLC52A2Q9HAB3 445 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 MBD5Q9P267 1494 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 AKR1B10O60218 316 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 WDR78Q5VTH9 848 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 NAPAP54920 295 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 GCKRQ14397 625 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 ITGA6P23229 1130 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 CEP170Q5SW79 1584 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 TOM1O60784 492 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 LTKP29376 864 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 AOX1Q06278 1338 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 LIG1P18858 919 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 SPAG1Q07617 926 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 DNAI1Q9UI46 699 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 MYO1BO43795 1136 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 USP8P40818 1118 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 CETN2P41208 172 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 BRAPQ7Z569 592 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 KIAA0232Q92628 1395 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 ABCC4O15439 1325 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 ANKRD62A6NC57 917 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 DYNC1I1O14576 645 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 IL17REQ8NFR9 667 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 CHMP4BP1P59074 171 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 CALM1P0DP23 149 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 CALM2P0DP24 149 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 CALM3P0DP25 149 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 USP44Q9H0E7 712 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 SAMM50Q9Y512 469 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 A0A1B0GVL5 298 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 B4E1Z4 1266 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 KCNQ3O43525 872 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-201ENST00000308580 ASIC1P78348 528 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms