RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM89AQ96GI7 184 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 EFCC1Q9HA90 598 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 XDHP47989 1333 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA1P04083 346 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRYD7Q5W111 196 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 POTEFA5A3E0 1075 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO1BO43795 1136 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXB7P09629 217 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 PROSER3Q2NL68 480 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 MOB2Q70IA6 237 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNL1Q8IU54 200 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXW7Q969H0 707 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMC5Q96C12 935 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 HYPKQ9NX55 129 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 RIPK4P57078 832 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SP3Q02447 781 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA2Q08379 1002 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF9Q3BBW0 867 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 STRIP1Q5VSL9 837 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 GMLQ99445 158 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT10BO00744 389 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE8AO60658 829 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKG1Q13976 671 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 LDLRAD1Q5T700 205 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHF1Q96S99 279 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 COA1Q9GZY4 146 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 MED23Q9ULK4 1368 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF1P21675 1872 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 EN2P19622 333 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF22Q14807 665 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 CHPF2Q9P2E5 772 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 PSME4Q14997 1843 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 SCN9AQ15858 1988 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 DLL1O00548 723 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX58O95786 925 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 DLGAP5Q15398 846 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K11Q16584 847 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC191Q8NCU4 936 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 WNK4Q96J92 1243 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 SASH1O94885 1247 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 GNRH1P01148 92 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 DACT2Q5SW24 774 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB129Q9H1M3 183 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC31BQ9NQW1 1179 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 LEMD3Q9Y2U8 911 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ4P48050 445 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 PRMT2P55345 433 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 CRHR2Q13324 411 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFAIP1Q13829 316 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 DPF3Q92784 378 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF428Q96B54 188 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF333Q96JL9 665 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
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