RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.18■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 POTEB2H3BUK9 544 aa20.18■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 GNAT2P19087 354 aa20.18■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 GNAQP50148 359 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 ERVK-7P63135 1459 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 ATP6V1AP38606 617 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 NLRP3Q96P20 1036 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 HSPA4P34932 840 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 TNIP1Q15025 636 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM47Q96LD4 638 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 FAM227BQ96M60 508 aa20.17■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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SCARB2-201ENST00000264896 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.16■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 LUZP1Q86V48 1076 aa20.16■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGEF10O15013 1369 aa20.16■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 A0A1B0GUL7 405 aa20.16■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.16■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 DNAI1Q9UI46 699 aa20.16■□□□□ 0.82
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SCARB2-201ENST00000264896 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
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SCARB2-201ENST00000264896 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.15■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 CUL5Q93034 780 aa20.15■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.15■□□□□ 0.82
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SCARB2-201ENST00000264896 USP44Q9H0E7 712 aa20.15■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 TUBB4AP04350 444 aa20.15■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.15■□□□□ 0.82
SCARB2-201ENST00000264896 SUCLG2Q96I99 432 aa20.15■□□□□ 0.82
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SCARB2-201ENST00000264896 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.14■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.14■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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SCARB2-201ENST00000264896 CALM3P0DP25 149 aa20.13■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 RFC4P35249 363 aa20.13■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 STAT6P42226 847 aa20.13■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 GCKRQ14397 625 aa20.13■□□□□ 0.81
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SCARB2-201ENST00000264896 BRD1O95696 1058 aa20.12■□□□□ 0.81
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SCARB2-201ENST00000264896 EXOC1Q9NV70 894 aa20.12■□□□□ 0.81
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SCARB2-201ENST00000264896 IL17REQ8NFR9 667 aa20.11■□□□□ 0.81
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SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 A0A1B0GVL5 298 aa20.11■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 PSMA7O14818 248 aa20.11■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 IFNKQ9P0W0 207 aa20.11■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 RXRAP19793 462 aa20.1■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.1■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.1■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.1■□□□□ 0.81
SCARB2-201ENST00000264896 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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