RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 STAP2Q9UGK3 403 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 CIAO1O76071 339 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 CLUL1Q15846 466 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 GALNT17Q6IS24 598 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 OGFOD1Q8N543 542 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 DEF6Q9H4E7 631 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 A6NNZ2 444 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 CNNM3Q8NE01 707 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.242e-6■■■□□ 14.9
SETX-201ENST00000224140 USO1O60763 962 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 SSH3Q8TE77 659 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 PTPRMP28827 1452 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 IGHDP01880 384 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 C8orf34Q49A92 452 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 PRPHP41219 470 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 ESPNB1AK53 854 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 ZBTB43O43298 467 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 WTAPQ15007 396 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 LPIN2Q92539 896 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 APPBP2Q92624 585 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 ATP6V1AP38606 617 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 MTA3Q9BTC8 594 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 TMX3Q96JJ7 454 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 EYA2O00167 538 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 PDE6BP35913 854 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 ERBB3P21860 1342 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 BICDL2A1A5D9 508 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 ERMNQ8TAM6 284 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 TTC6Q86TZ1 520 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.27□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 ATP5JP18859 108 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CHMLP26374 656 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 F6X3S4 739 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 GJB2P29033 226 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 HOOK3Q86VS8 718 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TSPY2A6NKD2 308 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 KIF5CO60282 957 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TNNI2P48788 182 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TRIM14Q14142 442 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.27□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SLC4A3P48751 1232 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NBPF4Q96M43 638 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 KIF4AO95239 1232 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 PHKG2P15735 406 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NDC80O14777 642 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SGSM2O43147 1006 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SLIT1O75093 1534 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 DEXIO95424 95 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FAM107BQ9H098 131 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NLRP5P59047 1200 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.26□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms