RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 LPIN2Q92539 896 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 CNKSR1Q969H4 720 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 KCNJ4P48050 445 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 TGFB2P61812 414 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 SCARF1Q14162 830 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 GORABQ5T7V8 394 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 PI16Q6UXB8 463 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 STAP2Q9UGK3 403 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 UFL1O94874 794 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 SLC5A1P13866 664 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 SNRKQ9NRH2 765 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 TTC22Q5TAA0 569 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 XDHP47989 1333 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 C6orf229H3BNL8 230 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 PIM2Q9P1W9 311 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 RIMBP2O15034 1052 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 UBE4AQ14139 1066 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC102BQ68D86 513 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 MPNDQ8N594 471 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 GGA1Q9UJY5 639 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 BCS1LQ9Y276 419 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 RILPL2Q969X0 211 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 LTBP1Q14766 1721 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 SDSP20132 328 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 JAG2Q9Y219 1238 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 MCAMP43121 646 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 SYT17Q9BSW7 474 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 CHGBP05060 677 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 GPATCH3Q96I76 525 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ATP5JP18859 108 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ATP2B4P23634 1241 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TMC4Q7Z404 712 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ZAP70P43403 619 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ERC2O15083 957 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 RASGRF1Q13972 1273 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 DOK7Q18PE1 504 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 VPS37DQ86XT2 251 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SNED1Q8TER0 1413 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 GOLIM4O00461 696 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 AOX1Q06278 1338 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CHD4Q14839 1912 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 HAUS7Q99871 368 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 AOC3Q16853 763 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 WASHC4Q2M389 1173 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC93Q567U6 631 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 AK9Q5TCS8 1911 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA5Q8NB90 893 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CD209Q9NNX6 404 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A3P48751 1232 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 RASSF7Q02833 373 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SEC24BO95487 1268 aa22.57■■□□□ 1.2
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