RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC102BQ68D86 513 aa22.28■■□□□ 1.16
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SIKE1-201ENST00000060969 CASZ1Q86V15 1759 aa22.28■■□□□ 1.16
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SIKE1-201ENST00000060969 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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SIKE1-201ENST00000060969 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.18■■□□□ 1.14
SIKE1-201ENST00000060969 A0A1B0GUL6 1792 aa22.17■■□□□ 1.14
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SIKE1-201ENST00000060969 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-201ENST00000060969 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-201ENST00000060969 NYXQ9GZU5 481 aa22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-201ENST00000060969 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIKE1-201ENST00000060969 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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SIKE1-201ENST00000060969 GPAA1O43292 621 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM37O94972 964 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-201ENST00000060969 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.16■■□□□ 1.14
SIKE1-201ENST00000060969 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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