RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Psme4Q5SSW2 1843 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Col1a1P11087 1453 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Prpmp5E9PXN1 296 aa26.28■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 CbarpQ66L44 698 aa26.28■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ecm29Q6PDI5 1840 aa26.28■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc51Q3URS9 406 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ankrd13cQ3UX43 541 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kcnc4Q8R1C0 628 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zbtb3Q91X45 518 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ets1P27577 440 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Terf1P70371 421 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Atp2b3Q0VF55 1220 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gsdma2Q32M21 443 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kiaa0753Q6A000 959 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fam13aQ8BGI4 693 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mmp8O70138 465 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 LtbrP50284 415 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rhbdl3P58873 404 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fchsd1Q6PFY1 688 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nphp1Q9QY53 687 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Myh15E9Q264 1925 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Abcc4E9Q236 1325 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Usp17lbE9Q9U0 468 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm4340L7N2C4 268 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 AaasP58742 546 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Podnl1Q6P3Y9 559 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ptrh1Q8BW00 204 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Glrx3Q9CQM9 337 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Neurod6P48986 337 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Znf18Q810A1 556 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lysmd1Q9D0E3 226 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 AampJ3QN89 436 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Psmd14O35593 310 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NfkbibQ60778 359 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kcnq5Q9JK45 933 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kifc2O08672 792 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cnot7Q60809 285 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Tmem130Q6NXM3 419 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mcmdc2E9Q956 681 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sept1P42209 366 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 OsbpQ3B7Z2 805 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Znf692Q3U381 531 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nell2Q61220 819 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm2163Q6PCY5 473 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Timm10P62073 90 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Spg7Q3ULF4 781 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fam102bQ8BQS4 339 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ift57Q8BXG3 429 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Myh4Q5SX39 1939 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nphp3Q7TNH6 1325 aa26.16■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rps12P63323 132 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pbx4Q99NE9 378 aa26.16■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 HunkO88866 714 aa26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NeflP08551 543 aa26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm5592Q3V0A6 857 aa26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Trmt44Q9D2Q2 713 aa26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mast3Q3U214 1321 aa26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NyxP83503 476 aa26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mctp2Q5RJH2 878 aa26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sirt2Q8VDQ8 389 aa26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Polr3dQ91WD1 398 aa26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ascc2Q91WR3 749 aa26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ankrd63A2ARS0 390 aa26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 EspnlQ3UYR4 1005 aa26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 A0A1W2P7S8 802 aa26.12■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 TsksO54887 585 aa26.12■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Izumo3A6PWV3 263 aa26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Trim27Q62158 513 aa26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sptlc3Q8BG54 563 aa26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Tmem67Q8BR76 992 aa26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccne2Q9Z238 404 aa26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Letm1Q9Z2I0 738 aa26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa26.09■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ifi207E9Q3L4 978 aa26.09■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa26.09■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Large2Q5XPT3 690 aa26.08■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Asap2Q7SIG6 958 aa26.08■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sept9Q80UG5 583 aa26.08■■□□□ 1.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Myh13B1AR69 1938 aa26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.8 ms