RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	CDC14C	A4D256	554 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	NME2P1	O60361	137 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	NUDT14	O95848	222 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	BCKDHB	P21953	392 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	GLP1R	P43220	463 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	STARD6	P59095	220 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	BANF2	Q9H503	90 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM131	Q92545	1883 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TTR	P02766	147 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	MIDN	Q504T8	468 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TFF2	Q03403	129 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	RGCC	Q9H4X1	137 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	STARD10	Q9Y365	291 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	C17orf105	B2RV13	164 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	AP4M1	O00189	453 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	MPIG6B	O95866	241 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	CST4	P01036	141 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	FPR2	P25090	351 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	THBS4	P35443	961 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	FHIT	P49789	147 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM50B	P56557	158 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SLC39A7	Q92504	469 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	GGACT	Q9BVM4	153 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	METTL12	A8MUP2	240 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SNCA	P37840	140 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	PMEL	P40967	661 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SOX7	Q9BT81	388 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	FAM206A	Q9NX38	181 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	APOD	P05090	189 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	ANOS1	P23352	680 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SULT1A1	P50225	295 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	CHRD	Q9H2X0	955 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TAAR5	O14804	337 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	PET100	P0DJ07	73 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	FCGR2C	P31995	323 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	SLC37A1	P57057	533 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	ERGIC1	Q969X5	290 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	RAB3C	Q96E17	227 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	TUBA4B	Q9H853	241 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	PRODH2	Q9UF12	536 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PMS1-222	ENST00000639501	IFITM10	A6NMD0	228 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	CLDN4	O14493	209 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	PLPP3	O14495	311 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	TSPAN15	O95858	294 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	H2BFM	P0C1H6	154 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF823	P16415	610 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	COL9A1	P20849	921 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	OR3A4P	P47883	348 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM33	P57088	247 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	PCK2	Q16822	640 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PMS1-222	ENST00000639501	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms