RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	DHDH	Q9UQ10	334 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A1W2PPW3	197 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OR4A8	P0C604	315 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OCM2	P0CE71	109 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	CD53	P19397	219 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	GABRA5	P31644	462 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	MAP2K3	P46734	347 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	GSK3A	P49840	483 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	TRAM1	Q15629	374 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	MSMP	Q1L6U9	139 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LTBP4-222	ENST00000598256	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	HS3ST1	O14792	307 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CTAG2	O75638	210 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SERPINA3	P01011	423 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TFAP2A	P05549	437 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CD2	P06729	351 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF250	P15622	560 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CD36	P16671	472 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF20	P17024	532 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SOX2	P48431	317 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ALDH3B2	P48448	385 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PSG7	Q13046	419 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	OR8B8	Q15620	311 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	THRSP	Q92748	146 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	HAVCR1	Q96D42	359 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256		V9GYS6	101 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PDZD2	O15018	2839 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A1W2PPR1	153 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM221A	A4D161	298 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	FAH	P16930	419 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	KITLG	P21583	273 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ACKR3	P25106	362 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SERPINF1	P36955	418 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TGFBR2	P37173	567 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	DDOST	P39656	456 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TLE4	Q04727	773 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256		Q499Y3	187 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	OR14A2	Q96R54	314 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	DSCAM	O60469	2012 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PLSCR5	A0PG75	271 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	LMX1B	O60663	402 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	IGHV3-13	P01766	116 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TNK1	Q13470	666 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	MOG	Q16653	247 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	MUC15	Q8N387	334 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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