RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3-9P01782 118 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 BGLAPP02818 100 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 IFNW1P05000 195 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PNMTP11086 282 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PAX1P15863 534 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ATP6V1B2P21281 511 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 CRYGSP22914 178 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 P2RY4P51582 365 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 UGT2B15P54855 530 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 H3F3AP84243 136 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 HTD2P86397 168 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TSC22D1Q15714 1073 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR4A47Q6IF82 309 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 SLC43A2Q8N370 569 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 KDM8Q8N371 416 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PFN4Q8NHR9 129 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PIGXQ8TBF5 258 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 LZICQ8WZA0 190 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MED18Q9BUE0 208 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 GLRX2Q9NS18 164 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 GPR173Q9NS66 373 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.371e-7■■■□□ 16.1
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF724A8MTY0 619 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FFAR1O14842 300 aa6.51□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 GMNNO75496 209 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 DIRAS1O95057 198 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR5F1O95221 314 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 HPRP00739 348 aa6.51□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 NR4A2P43354 598 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 CAMLGP49069 296 aa6.51□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 LGALS3BPQ08380 585 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 SLC17A1Q14916 467 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.51□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 C17orf77Q96MU5 243 aa6.51□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 EMC3Q9P0I2 261 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.51□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FUT1P19526 365 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 UGT2B10P36537 528 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR3A2P47893 321 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ATP5J2P56134 94 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 VLDLRP98155 873 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MS4A2Q01362 244 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 GAMTQ14353 236 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PDK3Q15120 406 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF74Q16587 644 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 AGAP6Q5VW22 663 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM225Q6GV28 225 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 CASP12Q6UXS9 341 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.5□□□□□ -1.37
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