RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 BAXQ07812 192 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 GCM1Q9NP62 436 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 MED29Q9NX70 200 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 GNG13Q9P2W3 67 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 YKT6O15498 198 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CTSVO60911 334 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CXCL2P19875 107 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 SSR4P51571 173 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CCR5P51681 352 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 RAB32Q13637 225 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 SHBQ15464 509 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PATE1Q8WXA2 126 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 SLC39A7Q92504 469 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM18Q96B42 140 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 MBP02144 154 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 NAT2P11245 290 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 KITLGP21583 273 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PAX6P26367 422 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 OTX2P32243 289 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 NR0B2Q15466 257 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 MRGPREQ86SM8 312 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 MITD1Q8WV92 249 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 C11orf40Q8WZ69 217 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PIK3IP1Q96FE7 263 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ARV1Q9H2C2 271 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 GPR173Q9NS66 373 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PLSCR5A0PG75 271 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PTP4A3O75365 173 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TCN2P20062 427 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 THBS3P49746 956 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 OR2T2Q6IF00 324 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PTX4Q96A99 478 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 SPSB1Q96BD6 273 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM68Q96MH6 324 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 EDEM2Q9BV94 578 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CA10Q9NS85 328 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 LHX6Q9UPM6 363 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 AP4M1O00189 453 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 IGHEP01854 428 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PPP2CBP62714 309 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PPP2CAP67775 309 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TESK1Q15569 626 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 GPR160Q9UJ42 338 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ABHD16AO95870 558 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 HLA-DOBP13765 273 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 GDF1P27539 372 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 SRYQ05066 204 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 IL13RA2Q14627 380 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ETFDHQ16134 617 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF813Q6ZN06 617 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 HHIPQ96QV1 700 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PPV9 198 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 IGF2P01344 180 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 OPRM1P35372 400 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 HTRA3P83110 453 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 MOGAT2Q3SYC2 334 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF787Q6DD87 383 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 OR51F2Q8NH61 342 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 F5P12259 2224 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms