RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536265.5

DDX11-208, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 5

Gene DDX11, Length 3,603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-208	ENST00000536265	GABRA1	P14867	456 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	MTCP1	P56278	107 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	PRSS12	P56730	875 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	PLP2	Q04941	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TNK1	Q13470	666 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	C3AR1	Q16581	482 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	CDH24	Q86UP0	819 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	GGN	Q86UU5	652 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	SEH1L	Q96EE3	360 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	FBXO17	Q96EF6	278 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265		A0A1B0GUH1	482 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	HPX	P02790	462 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	SP1	P08047	785 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	CHRM2	P08172	466 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	GSTT2	P0CG29	244 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	CXCL3	P19876	107 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	RAB6A	P20340	208 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	DRAM2	Q6UX65	266 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	APH1A	Q96BI3	265 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	REEP6	Q96HR9	211 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	HTR3B	O95264	441 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	LIPC	P11150	499 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	KISS1	Q15726	138 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	SLC25A28	Q96A46	364 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	C4BPB	P20851	252 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	VAMP1	P23763	118 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	THBS4	P35443	961 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF81	P51508	661 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	MEF2D	Q14814	521 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	RSU1	Q15404	277 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	PP6455	Q8WZ26	134 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	GPR35	Q9HC97	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ITGB2	P05107	769 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	CST2	P09228	141 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	UBB	P0CG47	229 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	CSRP2	Q16527	193 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF766	Q5HY98	468 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	PIGC	Q92535	297 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ICMT	O60725	284 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	FOXO1	Q12778	655 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	SLC6A7	Q99884	636 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	PRRT1	Q99946	306 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF716	A6NP11	495 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	AMY2B	P19961	511 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	GABRR1	P24046	479 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-208	ENST00000536265	SPRY4	Q9C004	299 aa		10.11	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms