RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	PRF1	P14222	555 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	IL32	P24001	234 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	AGTR1	P30556	359 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM50B	P56557	158 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	B2M	P61769	119 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	PPP1R1A	Q13522	171 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404		Q6ZSR3	168 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	NAA40	Q86UY6	237 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	LYZL4	Q96KX0	146 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	OR2AT4	A6NND4	320 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	SOCS1	O15524	211 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	UBB	P0CG47	229 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	MLF1	P58340	268 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404		A0A0U1RQV5	110 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	EFS	O43281	561 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	HCK	P08631	526 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	RAET1L	Q5VY80	246 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF546	Q86UE3	836 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404		V9GYS6	101 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FADS3-208	ENST00000529404	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	LIPC	P11150	499 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	ECH1	Q13011	328 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404		A0A0D9SG52	128 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404		B8ZZF3	427 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	MFNG	O00587	321 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	DHH	O43323	396 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	PMP2	P02689	132 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	THBS4	P35443	961 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	RAC1	P63000	192 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	COQ8A	Q8NI60	647 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	BANF2	Q9H503	90 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404		A0A0J9YW62	118 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404		A0A1W2PP11	408 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	OR5H15	A6NDH6	313 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	RAD51D	O75771	328 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	WDPCP	O95876	746 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	IFNA6	P05013	189 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	MGMT	P16455	207 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	MICB	Q29980	383 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FADS3-208	ENST00000529404	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.32	□□□□□ -0.28

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