RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 PLPP3O14495 311 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 XKRYO14609 159 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RNF13O43567 381 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FOXH1O75593 365 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MFN2O95140 757 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 STAMBPO95630 424 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PNPP00491 289 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IGHMP01871 453 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IFNW1P05000 195 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MSMBP08118 114 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NPIPA8P0DM63 369 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ADORA3P0DMS8 318 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CD79AP11912 226 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF250P15622 560 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ADRA2CP18825 462 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SHC1P29353 583 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CDKN1AP38936 164 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CAPZA2P47755 286 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 P2RY4P51582 365 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R41P59536 307 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MYBPC1Q00872 1141 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 HSF2Q03933 536 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ECH1Q13011 328 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR1Q1Q15612 314 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TRIP10Q15642 601 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF74Q16587 644 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA21Q7Z572 469 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM123Q8N131 208 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 C10orf53Q8N6V4 93 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 Q8NFD4 153 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NANPQ8TBE9 248 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ST7LQ8TDW4 575 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CMTM5Q96DZ9 223 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO17Q96EF6 278 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF583Q96ND8 569 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CDRT15Q96T59 188 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SEPHS2Q99611 448 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CGREF1Q99674 301 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MCHR1Q99705 422 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR11A1Q9GZK7 315 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NOX3Q9HBY0 568 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 INIPQ9NRY2 104 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NPAP1Q9NZP6 1156 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ABCA1O95477 2261 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 VPS13CQ709C8 3753 aa3.56□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 A0A096LNT2 108 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR6C6A6NF89 314 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NR5A2O00482 541 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ATP8B1O43520 1251 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFA2O43678 99 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IDH3BO43837 385 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RAMP1O60894 148 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TGFAP01135 160 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-13P01766 116 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OPN1LWP04000 364 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 LIPFP07098 398 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CD55P08174 381 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CST2P09228 141 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ASAH2BP0C7U1 165 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 UMPSP11172 480 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF35P13682 527 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MSR1P21757 451 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CRABP1P29762 137 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GRPRP30550 384 aa3.55□□□□□ -1.84
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