RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.56□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.56□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.56□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 AASSQ9UDR5 926 aa4.56□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.56□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 R4GMQ9 66 aa4.56□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 VPS13CQ709C8 3753 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 DAPL1A0PJW8 107 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 IRGMA1A4Y4 181 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 H0YL77 283 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 H7C1Q1 480 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 IFNL4K9M1U5 179 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MLNRO43193 412 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 FAM20BO75063 409 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 APOL3O95236 402 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 FSTL3O95633 263 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ATP6V1G2O95670 118 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CST4P01036 141 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 TTRP02766 147 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 LYNX1P0DP58 116 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CA6P23280 308 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 DCKP27707 260 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CD200P41217 278 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 SRP9P49458 86 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CCR9P51686 369 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF91Q05481 1191 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 SLC3A1Q07837 685 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MZT1Q08AG7 82 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MAB21L1Q13394 359 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 OR8B8Q15620 311 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 TIGD6Q17RP2 521 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF181Q2M3W8 571 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 HFEQ30201 348 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 SPRNQ5BIV9 151 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 LAIR2Q6ISS4 152 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 BIVMQ86UB2 503 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 SYS1Q8N2H4 156 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 YIPF7Q8N8F6 280 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 OR52I1Q8NGK6 324 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CNIH3Q8TBE1 160 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 RORBQ92753 470 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ELMOD3Q96FG2 381 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 C1orf159Q96HA4 380 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MEGF10Q96KG7 1140 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 TBX5Q99593 518 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 BPESC1Q9GZL8 116 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 GCM1Q9NP62 436 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 AMBNQ9NP70 447 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ERVK13-1Q9NX77 482 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 OR52A1Q9UKL2 312 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 IKZF2Q9UKS7 526 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 MPC1Q9Y5U8 109 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 V9GYS6 101 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 DSCAMO60469 2012 aa4.55□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 PTPN13Q12923 2485 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 LRBAP50851 2863 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 A0A1B0GTI1 187 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CLDN25C9JDP6 229 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 F5H5P2 479 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 CDC14BO60729 498 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 DHRS3O75911 302 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 HLA-DPB1P04440 258 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 ISG15P05161 165 aa4.54□□□□□ -1.68
SRPRB-205ENST00000494297 RPSAP08865 295 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
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