RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 MALSU1Q96EH3 234 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 BMFQ96LC9 184 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 RGCCQ9H4X1 137 aa12.02□□□□□ -0.49
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SH3BP1-206ENST00000469947 FBXL17Q9UF56 701 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 C1QL1O75973 258 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 LY86O95711 162 aa12.01□□□□□ -0.49
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SH3BP1-206ENST00000469947 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
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SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.99□□□□□ -0.49
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SH3BP1-206ENST00000469947 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 MED29Q9NX70 200 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 STARD10Q9Y365 291 aa11.99□□□□□ -0.49
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